記者2023年12月29日從蘭州大學(xué)獲悉，該校反芻動物研究所王維民教授團(tuán)隊發(fā)布了國內(nèi)首款基于大規(guī)模基因組選擇參考群的高性能綿羊基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”。這是該團(tuán)隊組織實施的“綿羊雙萬羊基因組計劃”第一階段的成果。
為提升我國綿羊基因組育種技術(shù)水平，王維民團(tuán)隊通過持續(xù)精準(zhǔn)的大規(guī)模性能測定與基因組重測序，率先在國內(nèi)構(gòu)建規(guī)模達(dá)10318只、羊只來源覆蓋全國8家國家湖羊核心育種場和4家規(guī)模化湖羊種羊場的基因組選擇參考群，累計獲得了80萬條表型數(shù)據(jù)和78TB的基因組數(shù)據(jù)。研究團(tuán)隊繪制出包含2000萬個高質(zhì)量遺傳變異位點超高分辨率的湖羊基因組遺傳變異圖譜，鑒定出飼料轉(zhuǎn)化率、生長速度、尾脂重、肌內(nèi)脂肪等一系列湖羊重要經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)鍵基因。
此后，研究團(tuán)隊聯(lián)合石家莊博瑞迪生物技術(shù)有限公司，利用大數(shù)據(jù)、生物信息學(xué)、育種學(xué)等相關(guān)技術(shù)，研發(fā)出包含45052個具有代表性、全局性、功能性位點的高性能45K基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”，并衍生出可在不同應(yīng)用場景下靈活使用的10K低密度和1K超低密度兩款配套使用的系列育種芯片。“芯片配套的遺傳評估技術(shù)，可用于湖羊基因組選擇育種、重要經(jīng)濟(jì)性狀基因定位、品種鑒定、家系劃分、系譜校正等。”王維民介紹。
據(jù)了解，“蘭大·華羊芯”的設(shè)計和遺傳評估技術(shù)已經(jīng)過業(yè)內(nèi)專家反復(fù)論證，并在天津奧群牧業(yè)有限公司、甘肅潤牧生物工程有限公司等有關(guān)企業(yè)進(jìn)行了近萬只羊的驗證。結(jié)果顯示，該育種芯片在重要經(jīng)濟(jì)性狀的選種準(zhǔn)確性上已經(jīng)可以比肩國際同類產(chǎn)品，尤其是在我國綿羊育種技術(shù)領(lǐng)域最具潛力的突破性性狀飼料轉(zhuǎn)化率的基因組預(yù)測方面，填補了全球綿羊基因組選擇育種技術(shù)的空白。